Ὅπως ὅλες οἱ μετεωρίτικες καὶ ἄλλες μονές, καὶ ἡ μονὴ τοῦ Ρουσάνου εἶχε στὴν κατοχή της διάφορα μετόχια. Μετόχι εἶναι ναός, οἴκημα, κτῆμα ἢ ἄλλο περιουσιακὸ στοιχεῖο ποὺ ἀνήκει σὲ μοναστήρι καὶ βρίσκεται ἔξω ἀπὸ τὴν κυρίως περιοχή του.
Τὸ παλαιότερο μετόχι ποὺ κατέχει ἡ μονὴ βρίσκεται στὴν Κόπερνα, τὸ σημερινὸ χωριὸ Αὔρα Καλαμπάκας, τὸ ὁποῖο στὰ 1574 οἱ μοναχοὶ τοῦ Ρουσάνου ἀγόρασαν ἀπὸ τοὺς Τούρκους, ἐνῶ πρὶν ἀνῆκε στὸ μετεωρίτικο μοναστήρι τοῦ Παντοκράτορος. Δύο χρόνια ἀργότερα, τὸν Ἰανουάριο τοῦ 1576, ὁ οἰκουμενικὸς πατριάρχης Ἱερεμίας Β ́ μὲ σιγίλλιό του ἐπικύρωσε τὴν ἀγορὰ καὶ κατοχή, ἀπὸ τὴν ἀκμάζουσα τότε καὶ οἰκονομικὰ εὔρωστη μονὴ Ρουσάνου, τοῦ μετοχίου στὴν Αὔρα. Τὸ σιγίλλιο αὐτό, ποὺ σώζεται στὸ πρωτότυπό του, βρίσκεται σήμερα στὴν Ἐθνικὴ Βιβλιοθήκη Ἑλλάδος.
Στὶς 22 Δεκεμβρίου τοῦ 1994 ὁ μακαριστὸς μητροπολίτης Σταγῶν καὶ Μετεώρων Σεραφεὶμ μὲ σχετικὸ ἔγγραφο (8/22.12.1994) ἀπέδωσε στὴ μονὴ Ρουσάνου τὴν κυριότητα δύο παλαιῶν μετεωρίτικων μονυδρίων καὶ τῆς ἀνέθεσε τὴν προσπάθεια συντήρησης, ἀναστήλωσης καὶ ἀνάδειξής τους: τῆς Μονῆς τῶν Ἁγίων Ἀποστόλων Ἁγιᾶς καθὼς καὶ τοῦ ἀσκητηρίου μὲ τὴν ἐπωνυμία Φυλακὲς τῶν Μοναχῶν (Παναγία τῶν Φυλακῶν) ἢ Ὀγλᾶς.
Μετόχια τῆς μονῆς Ρουσάνου θεωροῦνταν καὶ τὰ γειτονικὰ πρὸς αὐτὴν -κατεστραμμένα στὶς μέρες μας- μετεωρίτικα μονύδρια τῶν Ταξιαρχῶν καὶ τοῦ Καλλιστράτου, ὅπως ἀναφέρεται σὲ σιγίλλιο τοῦ οἰκουμενικοῦ πατριάρχη Τιμοθέου Β ́ τὸ 1614, περίληψη τοῦ ὁποίου δημοσίευσε ὁ ἑλληνομαθὴς Ρῶσος ἀρχιμανδρίτης Πορφύριος Οὐσπένσκι (Порфирий Успенский), καθὼς καὶ τὸ Κελλίον τοῦ Ἁγίου Ἀποστόλου Παύλου, ὅπως ἀναγράφεται σὲ περίληψη ἐπιστολῆς, ποὺ δὲν σώζεται σήμερα καὶ ποὺ εἶναι γνωστὴ ὡς «Διαθήκη τῶν στυλιτῶν τοῦ κελλίου τοῦ Ρουσάνου» (1544/45).
Τὸ 1996 ἡ γυναικεία ἀδελφότητα τῆς μονῆς ἀπέκτησε, μὲ τὴν προτροπὴ καὶ στήριξη τοῦ μακαριστοῦ μητροπολίτη Σταγῶν καὶ Μετεώρων Σεραφεὶμ, προσφορὰ τῆς ρουσανίτισσας μοναχῆς Βερονίκης καθὼς καὶ συνδρομὴ τῆς εὐλαβοῦς δωρητρίας Σοφίας Πρίφτη ἕνα μετόχι στὴ Θεοπέτρα, ὅπου οἱ μοναχὲς ἀσχολοῦνται μὲ κηπευτικὲς καὶ δενδροκομικὲς ἐργασίες, παράγοντας τὰ ἀναγκαῖα γιὰ τὴ συντήρηση τῆς ἀδελφότητας. Ἀπὸ τὸ 2005 δημιούργησαν στὸ χῶρο αὐτὸ καὶ ἕνα κηροπλαστεῖο, ὅπου παρασκευάζουν τὸ ἀπαραίτητο κερὶ γιὰ τὶς ἀνάγκες τῆς μονῆς, καθὼς καὶ ἐργαστήριο παρασκευῆς θυμιάματος. Τὸ 2016 ἔκτισαν στὴν ἴδια ἔκταση καὶ ἕνα μικρὸ παρεκκλήσι πρὸς τιμὴν τοῦ ἁγίου Τρύφωνος, θαυματουργοῦ προστάτη τῶν γεωργῶν καὶ τῶν ἀμπελουργῶν.